Lactobacillus johnsonii относятся к молочнокислым бактериям. Не являются преобладающим видом, но встречаются в составе нормальной микрофлоры кишечника человека.

Многие изученные штаммы Lactobacillus johnsonii  могут рассматриваться как культуры с доказанными пробиотическими свойствами. См. Пробиотики.

Для повышения функциональных (пробиотических) свойств добавляются главным образом в молочные продукты, входят в состав пробиотических добавок.